Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP6Q9GZR1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms