Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms