Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms