Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CEP44Q9C0F1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CEP44Q9C0F1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CEP44Q9C0F1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CEP44Q9C0F1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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