Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP4Q9C0A0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms