Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms