Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms