Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPS2Q9BXY5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms