Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RNF17Q9BXT8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
RNF17Q9BXT8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
RNF17Q9BXT8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
RNF17Q9BXT8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RNF17Q9BXT8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
RNF17Q9BXT8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RNF17Q9BXT8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RNF17Q9BXT8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RNF17Q9BXT8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RNF17Q9BXT8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RNF17Q9BXT8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms