Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms