Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF4Q9BXJ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms