Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms