Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms