Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms