Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC32Q9BV29 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC32Q9BV29 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms