Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
THUMPD2Q9BTF0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
THUMPD2Q9BTF0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
THUMPD2Q9BTF0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
THUMPD2Q9BTF0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms