Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NICN1Q9BSH3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NICN1Q9BSH3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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