Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM175Q9BSA9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms