Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms