Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PYM1Q9BRP8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PYM1Q9BRP8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PYM1Q9BRP8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PYM1Q9BRP8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYM1Q9BRP8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms