Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms