Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms