Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOPXQ9BPY8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOPXQ9BPY8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms