Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms