Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms