Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms