Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YME1L1Q96TA2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms