Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CRBNQ96SW2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRBNQ96SW2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms