Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms