Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms