Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms