Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH12Q96NR8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH12Q96NR8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms