Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCLT1Q96NL6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCLT1Q96NL6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms