Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms