Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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SAMD8Q96LT4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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SAMD8Q96LT4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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SAMD8Q96LT4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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