Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT74Q96LB3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT74Q96LB3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT74Q96LB3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT74Q96LB3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms