Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS2Q96L46 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms