Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A4AQ96JQ5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms