Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms