Protein–RNA interactions for Protein: Q96J86

CYYR1, Cysteine and tyrosine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYYR1Q96J86 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYYR1Q96J86 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYYR1Q96J86 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms