Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAX2Q96IS3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms