Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM46AQ96IP4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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