Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248.5 ms