Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RNFT2Q96EX2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms