Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHFRQ96EP1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms