Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms