Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms