Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF428Q96B54 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF428Q96B54 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms