Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms