Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP13Q92995 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP13Q92995 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP13Q92995 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP13Q92995 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP13Q92995 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP13Q92995 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP13Q92995 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP13Q92995 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP13Q92995 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP13Q92995 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP13Q92995 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP13Q92995 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP13Q92995 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP13Q92995 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP13Q92995 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP13Q92995 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP13Q92995 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP13Q92995 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP13Q92995 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP13Q92995 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP13Q92995 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP13Q92995 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP13Q92995 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP13Q92995 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP13Q92995 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP13Q92995 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP13Q92995 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP13Q92995 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP13Q92995 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP13Q92995 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP13Q92995 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP13Q92995 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP13Q92995 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP13Q92995 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP13Q92995 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP13Q92995 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP13Q92995 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP13Q92995 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP13Q92995 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms